Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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