Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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