Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 NOVA1-209ENST00000547619 947 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
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MKRN4PQ13434 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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MKRN4PQ13434 AC092809.4-201ENST00000420350 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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MKRN4PQ13434 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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MKRN4PQ13434 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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MKRN4PQ13434 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 COA1-202ENST00000310564 1085 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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