Protein–RNA interactions for Protein: Q10472

GALNT1, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT1Q10472 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GALNT1Q10472 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms