Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms