Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms