Protein–RNA interactions for Protein: Q09013

DMPK, Myotonin-protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMPKQ09013 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DMPKQ09013 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms