Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms