Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms