Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms