Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms