Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms