Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1DQ01668 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms