Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms