Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms