Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDK3Q00526 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDK3Q00526 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDK3Q00526 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDK3Q00526 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDK3Q00526 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDK3Q00526 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK3Q00526 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK3Q00526 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK3Q00526 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK3Q00526 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK3Q00526 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK3Q00526 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK3Q00526 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK3Q00526 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK3Q00526 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK3Q00526 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK3Q00526 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK3Q00526 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK3Q00526 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK3Q00526 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK3Q00526 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK3Q00526 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK3Q00526 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK3Q00526 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK3Q00526 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK3Q00526 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK3Q00526 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK3Q00526 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK3Q00526 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK3Q00526 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK3Q00526 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK3Q00526 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK3Q00526 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK3Q00526 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK3Q00526 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK3Q00526 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK3Q00526 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK3Q00526 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK3Q00526 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK3Q00526 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK3Q00526 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK3Q00526 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK3Q00526 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK3Q00526 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK3Q00526 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK3Q00526 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK3Q00526 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK3Q00526 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK3Q00526 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK3Q00526 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms