Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRX6P78412 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRX6P78412 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRX6P78412 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRX6P78412 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX6P78412 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX6P78412 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX6P78412 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX6P78412 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX6P78412 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX6P78412 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX6P78412 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX6P78412 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX6P78412 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX6P78412 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX6P78412 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX6P78412 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX6P78412 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX6P78412 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX6P78412 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX6P78412 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX6P78412 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX6P78412 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX6P78412 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX6P78412 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX6P78412 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX6P78412 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX6P78412 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX6P78412 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX6P78412 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX6P78412 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX6P78412 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX6P78412 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX6P78412 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX6P78412 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX6P78412 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX6P78412 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX6P78412 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX6P78412 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX6P78412 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX6P78412 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX6P78412 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX6P78412 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX6P78412 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX6P78412 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX6P78412 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX6P78412 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX6P78412 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX6P78412 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX6P78412 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX6P78412 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX6P78412 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX6P78412 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX6P78412 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX6P78412 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX6P78412 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX6P78412 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX6P78412 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX6P78412 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX6P78412 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
IRX6P78412 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
IRX6P78412 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX6P78412 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX6P78412 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX6P78412 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX6P78412 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX6P78412 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX6P78412 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX6P78412 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX6P78412 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX6P78412 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX6P78412 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX6P78412 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX6P78412 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX6P78412 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX6P78412 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX6P78412 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX6P78412 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX6P78412 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX6P78412 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX6P78412 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX6P78412 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX6P78412 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX6P78412 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX6P78412 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX6P78412 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX6P78412 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX6P78412 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX6P78412 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX6P78412 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX6P78412 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX6P78412 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX6P78412 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX6P78412 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX6P78412 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX6P78412 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX6P78412 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX6P78412 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX6P78412 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX6P78412 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 396.9 ms