Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms