Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS28P62857 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS28P62857 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS28P62857 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS28P62857 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS28P62857 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS28P62857 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS28P62857 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS28P62857 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS28P62857 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS28P62857 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS28P62857 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS28P62857 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS28P62857 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS28P62857 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS28P62857 DYNC1LI1-201ENST00000273130 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS28P62857 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS28P62857 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS28P62857 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS28P62857 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS28P62857 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS28P62857 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS28P62857 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS28P62857 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS28P62857 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS28P62857 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS28P62857 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS28P62857 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS28P62857 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS28P62857 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS28P62857 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS28P62857 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS28P62857 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS28P62857 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS28P62857 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS28P62857 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS28P62857 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS28P62857 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS28P62857 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS28P62857 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS28P62857 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS28P62857 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
RPS28P62857 TBC1D26-201ENST00000437605 1868 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
RPS28P62857 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
RPS28P62857 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
RPS28P62857 TBC1D3P2-203ENST00000581291 2088 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
RPS28P62857 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
RPS28P62857 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
RPS28P62857 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
RPS28P62857 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
RPS28P62857 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
RPS28P62857 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
RPS28P62857 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS28P62857 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS28P62857 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS28P62857 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS28P62857 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS28P62857 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS28P62857 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS28P62857 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS28P62857 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS28P62857 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS28P62857 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS28P62857 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS28P62857 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS28P62857 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS28P62857 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS28P62857 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS28P62857 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS28P62857 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS28P62857 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS28P62857 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS28P62857 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS28P62857 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS28P62857 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS28P62857 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS28P62857 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS28P62857 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS28P62857 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS28P62857 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS28P62857 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS28P62857 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS28P62857 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS28P62857 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS28P62857 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS28P62857 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS28P62857 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS28P62857 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS28P62857 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS28P62857 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS28P62857 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS28P62857 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS28P62857 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS28P62857 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS28P62857 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS28P62857 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS28P62857 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS28P62857 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS28P62857 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS28P62857 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms