Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO4P61968 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO4P61968 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO4P61968 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO4P61968 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO4P61968 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO4P61968 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO4P61968 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO4P61968 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO4P61968 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO4P61968 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO4P61968 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO4P61968 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO4P61968 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO4P61968 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO4P61968 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO4P61968 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO4P61968 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO4P61968 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO4P61968 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO4P61968 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO4P61968 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO4P61968 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO4P61968 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO4P61968 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO4P61968 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO4P61968 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO4P61968 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO4P61968 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO4P61968 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO4P61968 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO4P61968 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO4P61968 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO4P61968 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO4P61968 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO4P61968 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO4P61968 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO4P61968 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO4P61968 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO4P61968 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO4P61968 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO4P61968 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO4P61968 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO4P61968 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO4P61968 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO4P61968 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO4P61968 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO4P61968 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO4P61968 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO4P61968 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO4P61968 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO4P61968 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO4P61968 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO4P61968 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO4P61968 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO4P61968 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO4P61968 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO4P61968 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO4P61968 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO4P61968 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO4P61968 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO4P61968 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO4P61968 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO4P61968 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO4P61968 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO4P61968 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO4P61968 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO4P61968 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO4P61968 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO4P61968 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO4P61968 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO4P61968 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO4P61968 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO4P61968 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO4P61968 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO4P61968 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO4P61968 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO4P61968 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LMO4P61968 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LMO4P61968 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LMO4P61968 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LMO4P61968 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LMO4P61968 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LMO4P61968 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LMO4P61968 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LMO4P61968 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO4P61968 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO4P61968 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO4P61968 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO4P61968 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO4P61968 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO4P61968 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO4P61968 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO4P61968 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO4P61968 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO4P61968 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO4P61968 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO4P61968 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO4P61968 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO4P61968 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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