Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms