Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME5P56597 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NME5P56597 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NME5P56597 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME5P56597 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME5P56597 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME5P56597 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME5P56597 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME5P56597 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME5P56597 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME5P56597 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME5P56597 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NME5P56597 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME5P56597 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME5P56597 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME5P56597 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME5P56597 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME5P56597 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME5P56597 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME5P56597 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME5P56597 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME5P56597 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME5P56597 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME5P56597 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME5P56597 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME5P56597 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME5P56597 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME5P56597 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME5P56597 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME5P56597 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME5P56597 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME5P56597 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME5P56597 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME5P56597 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NME5P56597 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME5P56597 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NME5P56597 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME5P56597 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME5P56597 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME5P56597 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME5P56597 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME5P56597 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME5P56597 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME5P56597 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NME5P56597 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME5P56597 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME5P56597 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME5P56597 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME5P56597 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME5P56597 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME5P56597 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME5P56597 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME5P56597 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME5P56597 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME5P56597 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME5P56597 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME5P56597 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME5P56597 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME5P56597 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME5P56597 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME5P56597 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME5P56597 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME5P56597 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME5P56597 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME5P56597 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME5P56597 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME5P56597 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME5P56597 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME5P56597 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME5P56597 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME5P56597 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NME5P56597 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME5P56597 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME5P56597 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NME5P56597 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME5P56597 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME5P56597 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME5P56597 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME5P56597 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME5P56597 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NME5P56597 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME5P56597 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NME5P56597 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME5P56597 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME5P56597 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME5P56597 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME5P56597 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME5P56597 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME5P56597 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME5P56597 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME5P56597 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME5P56597 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NME5P56597 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME5P56597 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME5P56597 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME5P56597 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME5P56597 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME5P56597 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME5P56597 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME5P56597 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms