Protein–RNA interactions for Protein: P56377

AP1S2, AP-1 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S2P56377 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP1S2P56377 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms