Protein–RNA interactions for Protein: P56278

MTCP1, Protein p13 MTCP-1, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTCP1P56278 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTCP1P56278 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTCP1P56278 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTCP1P56278 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTCP1P56278 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTCP1P56278 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTCP1P56278 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MTCP1P56278 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTCP1P56278 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTCP1P56278 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTCP1P56278 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTCP1P56278 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTCP1P56278 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTCP1P56278 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTCP1P56278 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTCP1P56278 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTCP1P56278 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTCP1P56278 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTCP1P56278 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTCP1P56278 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTCP1P56278 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTCP1P56278 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTCP1P56278 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTCP1P56278 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTCP1P56278 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTCP1P56278 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTCP1P56278 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTCP1P56278 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTCP1P56278 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTCP1P56278 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTCP1P56278 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTCP1P56278 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTCP1P56278 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTCP1P56278 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTCP1P56278 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTCP1P56278 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTCP1P56278 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTCP1P56278 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTCP1P56278 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTCP1P56278 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTCP1P56278 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MTCP1P56278 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTCP1P56278 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTCP1P56278 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTCP1P56278 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTCP1P56278 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTCP1P56278 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTCP1P56278 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTCP1P56278 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTCP1P56278 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTCP1P56278 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTCP1P56278 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTCP1P56278 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTCP1P56278 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTCP1P56278 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTCP1P56278 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms