Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP6P55212 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP6P55212 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP6P55212 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP6P55212 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP6P55212 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP6P55212 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP6P55212 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP6P55212 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP6P55212 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP6P55212 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP6P55212 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP6P55212 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP6P55212 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP6P55212 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP6P55212 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP6P55212 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP6P55212 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP6P55212 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP6P55212 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP6P55212 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP6P55212 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP6P55212 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP6P55212 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP6P55212 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP6P55212 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP6P55212 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP6P55212 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP6P55212 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP6P55212 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP6P55212 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP6P55212 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP6P55212 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP6P55212 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP6P55212 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP6P55212 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP6P55212 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP6P55212 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP6P55212 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP6P55212 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP6P55212 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP6P55212 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP6P55212 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP6P55212 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP6P55212 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP6P55212 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP6P55212 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP6P55212 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP6P55212 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP6P55212 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP6P55212 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP6P55212 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP6P55212 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP6P55212 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP6P55212 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP6P55212 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP6P55212 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP6P55212 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP6P55212 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP6P55212 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP6P55212 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP6P55212 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP6P55212 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP6P55212 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP6P55212 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP6P55212 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP6P55212 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP6P55212 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP6P55212 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP6P55212 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP6P55212 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP6P55212 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP6P55212 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP6P55212 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP6P55212 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP6P55212 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP6P55212 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP6P55212 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP6P55212 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP6P55212 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP6P55212 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP6P55212 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP6P55212 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP6P55212 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP6P55212 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP6P55212 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP6P55212 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP6P55212 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP6P55212 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP6P55212 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP6P55212 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP6P55212 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP6P55212 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP6P55212 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP6P55212 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP6P55212 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP6P55212 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CASP6P55212 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP6P55212 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP6P55212 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms