Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERFP50548 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERFP50548 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERFP50548 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERFP50548 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERFP50548 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERFP50548 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERFP50548 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERFP50548 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERFP50548 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERFP50548 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERFP50548 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERFP50548 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERFP50548 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERFP50548 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERFP50548 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERFP50548 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERFP50548 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERFP50548 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERFP50548 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERFP50548 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERFP50548 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERFP50548 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERFP50548 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERFP50548 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERFP50548 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERFP50548 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERFP50548 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERFP50548 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERFP50548 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERFP50548 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERFP50548 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERFP50548 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERFP50548 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERFP50548 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERFP50548 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERFP50548 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERFP50548 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERFP50548 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERFP50548 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERFP50548 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERFP50548 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERFP50548 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERFP50548 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERFP50548 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERFP50548 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERFP50548 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERFP50548 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERFP50548 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERFP50548 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERFP50548 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERFP50548 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERFP50548 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERFP50548 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERFP50548 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ERFP50548 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERFP50548 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERFP50548 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERFP50548 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERFP50548 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERFP50548 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERFP50548 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERFP50548 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERFP50548 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERFP50548 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERFP50548 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERFP50548 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERFP50548 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERFP50548 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERFP50548 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERFP50548 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERFP50548 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERFP50548 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERFP50548 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERFP50548 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERFP50548 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERFP50548 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERFP50548 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERFP50548 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERFP50548 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERFP50548 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERFP50548 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERFP50548 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERFP50548 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERFP50548 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERFP50548 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERFP50548 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERFP50548 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERFP50548 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERFP50548 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERFP50548 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERFP50548 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERFP50548 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERFP50548 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERFP50548 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERFP50548 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERFP50548 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERFP50548 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERFP50548 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERFP50548 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms