Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 AC010181.2-201ENST00000483759 482 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 MALAT1-217ENST00000620902 352 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSEN1P49768 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms