Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms