Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TTPAP49638 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TTPAP49638 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTPAP49638 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTPAP49638 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTPAP49638 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTPAP49638 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTPAP49638 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTPAP49638 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTPAP49638 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTPAP49638 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTPAP49638 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTPAP49638 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTPAP49638 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTPAP49638 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTPAP49638 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTPAP49638 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTPAP49638 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTPAP49638 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTPAP49638 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTPAP49638 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTPAP49638 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTPAP49638 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTPAP49638 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTPAP49638 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTPAP49638 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTPAP49638 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTPAP49638 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTPAP49638 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTPAP49638 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTPAP49638 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTPAP49638 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTPAP49638 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTPAP49638 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTPAP49638 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTPAP49638 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTPAP49638 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTPAP49638 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTPAP49638 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTPAP49638 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTPAP49638 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTPAP49638 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTPAP49638 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTPAP49638 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTPAP49638 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTPAP49638 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTPAP49638 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTPAP49638 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTPAP49638 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTPAP49638 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTPAP49638 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTPAP49638 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTPAP49638 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTPAP49638 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTPAP49638 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTPAP49638 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTPAP49638 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTPAP49638 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTPAP49638 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTPAP49638 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTPAP49638 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTPAP49638 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTPAP49638 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTPAP49638 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTPAP49638 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTPAP49638 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTPAP49638 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTPAP49638 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTPAP49638 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTPAP49638 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTPAP49638 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTPAP49638 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTPAP49638 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTPAP49638 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTPAP49638 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTPAP49638 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTPAP49638 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTPAP49638 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTPAP49638 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTPAP49638 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTPAP49638 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTPAP49638 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTPAP49638 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTPAP49638 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTPAP49638 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTPAP49638 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTPAP49638 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTPAP49638 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTPAP49638 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTPAP49638 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTPAP49638 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TTPAP49638 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTPAP49638 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TTPAP49638 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTPAP49638 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTPAP49638 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTPAP49638 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTPAP49638 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTPAP49638 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTPAP49638 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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