Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RANGAP1P46060 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms