Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PIK3CBP42338 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms