Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMPOP42166 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMPOP42166 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMPOP42166 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMPOP42166 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMPOP42166 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMPOP42166 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMPOP42166 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMPOP42166 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMPOP42166 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TMPOP42166 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMPOP42166 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMPOP42166 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TMPOP42166 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMPOP42166 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMPOP42166 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMPOP42166 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TMPOP42166 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMPOP42166 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMPOP42166 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMPOP42166 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMPOP42166 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMPOP42166 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMPOP42166 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMPOP42166 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMPOP42166 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMPOP42166 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMPOP42166 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TMPOP42166 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMPOP42166 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMPOP42166 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMPOP42166 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMPOP42166 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMPOP42166 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMPOP42166 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMPOP42166 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMPOP42166 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMPOP42166 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMPOP42166 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMPOP42166 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMPOP42166 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TMPOP42166 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMPOP42166 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMPOP42166 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMPOP42166 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMPOP42166 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMPOP42166 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMPOP42166 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMPOP42166 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMPOP42166 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMPOP42166 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMPOP42166 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMPOP42166 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMPOP42166 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMPOP42166 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMPOP42166 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMPOP42166 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMPOP42166 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMPOP42166 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMPOP42166 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TMPOP42166 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMPOP42166 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMPOP42166 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMPOP42166 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMPOP42166 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMPOP42166 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMPOP42166 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMPOP42166 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMPOP42166 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMPOP42166 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMPOP42166 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMPOP42166 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMPOP42166 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMPOP42166 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMPOP42166 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMPOP42166 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMPOP42166 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TMPOP42166 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMPOP42166 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMPOP42166 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMPOP42166 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TMPOP42166 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMPOP42166 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMPOP42166 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMPOP42166 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMPOP42166 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMPOP42166 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMPOP42166 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMPOP42166 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMPOP42166 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMPOP42166 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TMPOP42166 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMPOP42166 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMPOP42166 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TMPOP42166 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMPOP42166 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMPOP42166 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMPOP42166 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMPOP42166 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMPOP42166 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms