Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP62P37198 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP62P37198 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP62P37198 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP62P37198 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP62P37198 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP62P37198 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP62P37198 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP62P37198 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP62P37198 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP62P37198 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP62P37198 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP62P37198 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP62P37198 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP62P37198 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP62P37198 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP62P37198 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP62P37198 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP62P37198 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP62P37198 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP62P37198 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP62P37198 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP62P37198 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP62P37198 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP62P37198 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP62P37198 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP62P37198 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP62P37198 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP62P37198 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP62P37198 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP62P37198 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP62P37198 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP62P37198 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP62P37198 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP62P37198 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP62P37198 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP62P37198 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP62P37198 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP62P37198 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP62P37198 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP62P37198 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP62P37198 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP62P37198 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP62P37198 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP62P37198 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP62P37198 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP62P37198 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP62P37198 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP62P37198 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP62P37198 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP62P37198 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP62P37198 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP62P37198 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP62P37198 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP62P37198 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP62P37198 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP62P37198 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP62P37198 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP62P37198 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP62P37198 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP62P37198 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP62P37198 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP62P37198 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP62P37198 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP62P37198 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP62P37198 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP62P37198 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP62P37198 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP62P37198 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP62P37198 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP62P37198 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP62P37198 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP62P37198 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP62P37198 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP62P37198 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP62P37198 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP62P37198 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP62P37198 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP62P37198 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP62P37198 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP62P37198 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP62P37198 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP62P37198 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP62P37198 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP62P37198 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP62P37198 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP62P37198 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP62P37198 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP62P37198 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP62P37198 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP62P37198 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP62P37198 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP62P37198 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP62P37198 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP62P37198 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP62P37198 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP62P37198 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP62P37198 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP62P37198 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP62P37198 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms