Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CPS1P31327 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CPS1P31327 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CPS1P31327 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CPS1P31327 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CPS1P31327 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CPS1P31327 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CPS1P31327 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CPS1P31327 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CPS1P31327 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CPS1P31327 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CPS1P31327 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CPS1P31327 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CPS1P31327 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CPS1P31327 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CPS1P31327 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CPS1P31327 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CPS1P31327 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CPS1P31327 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CPS1P31327 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CPS1P31327 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CPS1P31327 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CPS1P31327 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CPS1P31327 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CPS1P31327 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CPS1P31327 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CPS1P31327 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CPS1P31327 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CPS1P31327 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CPS1P31327 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CPS1P31327 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CPS1P31327 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CPS1P31327 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CPS1P31327 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CPS1P31327 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CPS1P31327 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CPS1P31327 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CPS1P31327 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CPS1P31327 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CPS1P31327 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CPS1P31327 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CPS1P31327 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CPS1P31327 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CPS1P31327 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CPS1P31327 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CPS1P31327 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CPS1P31327 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CPS1P31327 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CPS1P31327 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CPS1P31327 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CPS1P31327 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CPS1P31327 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CPS1P31327 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CPS1P31327 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CPS1P31327 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CPS1P31327 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CPS1P31327 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CPS1P31327 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CPS1P31327 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CPS1P31327 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CPS1P31327 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CPS1P31327 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CPS1P31327 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CPS1P31327 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CPS1P31327 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CPS1P31327 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CPS1P31327 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CPS1P31327 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CPS1P31327 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CPS1P31327 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CPS1P31327 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CPS1P31327 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CPS1P31327 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CPS1P31327 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CPS1P31327 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CPS1P31327 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CPS1P31327 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CPS1P31327 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CPS1P31327 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CPS1P31327 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CPS1P31327 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CPS1P31327 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CPS1P31327 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CPS1P31327 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CPS1P31327 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CPS1P31327 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CPS1P31327 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CPS1P31327 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CPS1P31327 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CPS1P31327 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CPS1P31327 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CPS1P31327 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CPS1P31327 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CPS1P31327 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CPS1P31327 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CPS1P31327 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CPS1P31327 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CPS1P31327 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CPS1P31327 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CPS1P31327 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms