Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TM4SF1P30408 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms