Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE4AP27815 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms