Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMGB2P26583 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.7 ms