Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms