Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSSP25774 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSSP25774 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSSP25774 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSSP25774 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSSP25774 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSSP25774 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSSP25774 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSSP25774 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSSP25774 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSSP25774 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSSP25774 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSSP25774 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSSP25774 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSSP25774 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSSP25774 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSSP25774 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSSP25774 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSSP25774 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSSP25774 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSSP25774 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSSP25774 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSSP25774 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSSP25774 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSSP25774 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSSP25774 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSSP25774 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSSP25774 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSSP25774 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSSP25774 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSSP25774 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSSP25774 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSSP25774 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSSP25774 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSSP25774 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSSP25774 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSSP25774 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSSP25774 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSSP25774 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSSP25774 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSSP25774 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSSP25774 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSSP25774 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSSP25774 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSSP25774 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSSP25774 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSSP25774 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSSP25774 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSSP25774 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSSP25774 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSSP25774 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSSP25774 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSSP25774 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSSP25774 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSSP25774 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSSP25774 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSSP25774 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSSP25774 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSSP25774 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSSP25774 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSSP25774 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSSP25774 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSSP25774 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSSP25774 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSSP25774 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSSP25774 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSSP25774 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSSP25774 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSSP25774 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSSP25774 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSSP25774 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSSP25774 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSSP25774 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSSP25774 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSSP25774 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSSP25774 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSSP25774 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSSP25774 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSSP25774 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSSP25774 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSSP25774 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSSP25774 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSSP25774 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSSP25774 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSSP25774 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSSP25774 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSSP25774 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSSP25774 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSSP25774 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSSP25774 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSSP25774 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSSP25774 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSSP25774 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSSP25774 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSSP25774 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSSP25774 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSSP25774 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSSP25774 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSSP25774 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSSP25774 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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