Protein–RNA interactions for Protein: P25705

ATP5A1, ATP synthase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5A1P25705 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5A1P25705 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms