Protein–RNA interactions for Protein: P23193

TCEA1, Transcription elongation factor A protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1P23193 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms