Protein–RNA interactions for Protein: P22897

MRC1, Macrophage mannose receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRC1P22897 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRC1P22897 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRC1P22897 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRC1P22897 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRC1P22897 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRC1P22897 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRC1P22897 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRC1P22897 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRC1P22897 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRC1P22897 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRC1P22897 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRC1P22897 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRC1P22897 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRC1P22897 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRC1P22897 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRC1P22897 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRC1P22897 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRC1P22897 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRC1P22897 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRC1P22897 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRC1P22897 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRC1P22897 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRC1P22897 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MRC1P22897 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRC1P22897 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRC1P22897 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRC1P22897 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRC1P22897 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MRC1P22897 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MRC1P22897 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRC1P22897 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRC1P22897 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRC1P22897 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRC1P22897 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRC1P22897 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRC1P22897 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRC1P22897 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRC1P22897 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRC1P22897 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRC1P22897 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRC1P22897 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRC1P22897 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MRC1P22897 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRC1P22897 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRC1P22897 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRC1P22897 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRC1P22897 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRC1P22897 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRC1P22897 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRC1P22897 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRC1P22897 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRC1P22897 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRC1P22897 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRC1P22897 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRC1P22897 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRC1P22897 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRC1P22897 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRC1P22897 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRC1P22897 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRC1P22897 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRC1P22897 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRC1P22897 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRC1P22897 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRC1P22897 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MRC1P22897 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRC1P22897 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRC1P22897 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MRC1P22897 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MRC1P22897 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRC1P22897 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRC1P22897 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRC1P22897 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRC1P22897 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MRC1P22897 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRC1P22897 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRC1P22897 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRC1P22897 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRC1P22897 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRC1P22897 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRC1P22897 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRC1P22897 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRC1P22897 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRC1P22897 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MRC1P22897 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRC1P22897 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRC1P22897 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRC1P22897 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRC1P22897 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRC1P22897 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRC1P22897 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRC1P22897 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MRC1P22897 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRC1P22897 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MRC1P22897 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRC1P22897 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRC1P22897 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRC1P22897 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRC1P22897 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRC1P22897 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRC1P22897 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms