Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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CCL3L1P16619 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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CCL3L1P16619 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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CCL3L1P16619 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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CCL3L1P16619 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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CCL3L1P16619 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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