Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD46P15529 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD46P15529 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CD46P15529 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD46P15529 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CD46P15529 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD46P15529 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD46P15529 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CD46P15529 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD46P15529 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD46P15529 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD46P15529 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD46P15529 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CD46P15529 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD46P15529 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD46P15529 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD46P15529 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD46P15529 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD46P15529 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD46P15529 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD46P15529 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD46P15529 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD46P15529 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD46P15529 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD46P15529 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD46P15529 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD46P15529 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD46P15529 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD46P15529 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD46P15529 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD46P15529 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD46P15529 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD46P15529 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD46P15529 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD46P15529 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD46P15529 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD46P15529 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD46P15529 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD46P15529 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD46P15529 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD46P15529 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD46P15529 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD46P15529 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD46P15529 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CD46P15529 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD46P15529 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD46P15529 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD46P15529 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD46P15529 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD46P15529 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CD46P15529 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD46P15529 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD46P15529 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD46P15529 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD46P15529 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD46P15529 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD46P15529 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD46P15529 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD46P15529 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD46P15529 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD46P15529 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD46P15529 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD46P15529 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD46P15529 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD46P15529 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD46P15529 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD46P15529 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD46P15529 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD46P15529 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD46P15529 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD46P15529 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD46P15529 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD46P15529 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD46P15529 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD46P15529 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD46P15529 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD46P15529 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD46P15529 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD46P15529 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD46P15529 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD46P15529 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD46P15529 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CD46P15529 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CD46P15529 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD46P15529 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD46P15529 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CD46P15529 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD46P15529 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD46P15529 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD46P15529 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD46P15529 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD46P15529 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CD46P15529 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD46P15529 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD46P15529 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD46P15529 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD46P15529 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD46P15529 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD46P15529 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD46P15529 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms