Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 AKR1B10P2-201ENST00000577332 927 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms