Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 METTL23-207ENST00000588783 1184 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 ITGB5-AS1-201ENST00000495917 460 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXB3P14651 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXB3P14651 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXB3P14651 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXB3P14651 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms