Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms