Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP10P09238 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP10P09238 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP10P09238 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP10P09238 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP10P09238 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP10P09238 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP10P09238 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP10P09238 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP10P09238 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP10P09238 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP10P09238 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP10P09238 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP10P09238 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP10P09238 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP10P09238 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP10P09238 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP10P09238 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP10P09238 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP10P09238 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP10P09238 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP10P09238 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP10P09238 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP10P09238 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP10P09238 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP10P09238 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP10P09238 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP10P09238 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP10P09238 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP10P09238 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP10P09238 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP10P09238 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP10P09238 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP10P09238 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP10P09238 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP10P09238 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP10P09238 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP10P09238 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP10P09238 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP10P09238 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP10P09238 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP10P09238 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP10P09238 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP10P09238 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP10P09238 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP10P09238 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP10P09238 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP10P09238 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP10P09238 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP10P09238 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP10P09238 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP10P09238 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP10P09238 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP10P09238 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP10P09238 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP10P09238 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP10P09238 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
MMP10P09238 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MMP10P09238 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP10P09238 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP10P09238 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP10P09238 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP10P09238 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP10P09238 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP10P09238 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP10P09238 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP10P09238 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP10P09238 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP10P09238 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP10P09238 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP10P09238 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP10P09238 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP10P09238 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP10P09238 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP10P09238 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP10P09238 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP10P09238 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP10P09238 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP10P09238 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP10P09238 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP10P09238 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP10P09238 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP10P09238 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP10P09238 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP10P09238 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP10P09238 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP10P09238 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP10P09238 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP10P09238 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MMP10P09238 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MMP10P09238 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MMP10P09238 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MMP10P09238 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MMP10P09238 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MMP10P09238 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MMP10P09238 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MMP10P09238 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MMP10P09238 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MMP10P09238 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MMP10P09238 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms