Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOA4P06727 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOA4P06727 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOA4P06727 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOA4P06727 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOA4P06727 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOA4P06727 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOA4P06727 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOA4P06727 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOA4P06727 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOA4P06727 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOA4P06727 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOA4P06727 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOA4P06727 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOA4P06727 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOA4P06727 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOA4P06727 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
APOA4P06727 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOA4P06727 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
APOA4P06727 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOA4P06727 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
APOA4P06727 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOA4P06727 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOA4P06727 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOA4P06727 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOA4P06727 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOA4P06727 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOA4P06727 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOA4P06727 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOA4P06727 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOA4P06727 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOA4P06727 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOA4P06727 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOA4P06727 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOA4P06727 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOA4P06727 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOA4P06727 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOA4P06727 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOA4P06727 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOA4P06727 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOA4P06727 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOA4P06727 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOA4P06727 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOA4P06727 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOA4P06727 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOA4P06727 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOA4P06727 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOA4P06727 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOA4P06727 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOA4P06727 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOA4P06727 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOA4P06727 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
APOA4P06727 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
APOA4P06727 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
APOA4P06727 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOA4P06727 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOA4P06727 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOA4P06727 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOA4P06727 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOA4P06727 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOA4P06727 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOA4P06727 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOA4P06727 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOA4P06727 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOA4P06727 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOA4P06727 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOA4P06727 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOA4P06727 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOA4P06727 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOA4P06727 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
APOA4P06727 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
APOA4P06727 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
APOA4P06727 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
APOA4P06727 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOA4P06727 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOA4P06727 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOA4P06727 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOA4P06727 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOA4P06727 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOA4P06727 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOA4P06727 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOA4P06727 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOA4P06727 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOA4P06727 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOA4P06727 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOA4P06727 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
APOA4P06727 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOA4P06727 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
APOA4P06727 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOA4P06727 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOA4P06727 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOA4P06727 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOA4P06727 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOA4P06727 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOA4P06727 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOA4P06727 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOA4P06727 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
APOA4P06727 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOA4P06727 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOA4P06727 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms