Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTMAP06454 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTMAP06454 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTMAP06454 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTMAP06454 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTMAP06454 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTMAP06454 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTMAP06454 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTMAP06454 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTMAP06454 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTMAP06454 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTMAP06454 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTMAP06454 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTMAP06454 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PTMAP06454 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTMAP06454 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTMAP06454 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTMAP06454 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTMAP06454 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PTMAP06454 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTMAP06454 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTMAP06454 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTMAP06454 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTMAP06454 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTMAP06454 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTMAP06454 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTMAP06454 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTMAP06454 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTMAP06454 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTMAP06454 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTMAP06454 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTMAP06454 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTMAP06454 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTMAP06454 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTMAP06454 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTMAP06454 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTMAP06454 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTMAP06454 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTMAP06454 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTMAP06454 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTMAP06454 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTMAP06454 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTMAP06454 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTMAP06454 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTMAP06454 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTMAP06454 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTMAP06454 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTMAP06454 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTMAP06454 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTMAP06454 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PTMAP06454 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTMAP06454 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTMAP06454 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTMAP06454 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTMAP06454 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTMAP06454 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTMAP06454 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTMAP06454 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTMAP06454 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTMAP06454 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTMAP06454 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTMAP06454 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTMAP06454 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTMAP06454 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTMAP06454 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTMAP06454 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTMAP06454 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTMAP06454 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTMAP06454 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PTMAP06454 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTMAP06454 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTMAP06454 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTMAP06454 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTMAP06454 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTMAP06454 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PTMAP06454 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTMAP06454 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTMAP06454 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTMAP06454 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTMAP06454 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTMAP06454 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTMAP06454 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTMAP06454 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTMAP06454 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTMAP06454 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTMAP06454 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTMAP06454 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTMAP06454 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTMAP06454 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PTMAP06454 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTMAP06454 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTMAP06454 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PTMAP06454 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTMAP06454 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTMAP06454 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PTMAP06454 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTMAP06454 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTMAP06454 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTMAP06454 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTMAP06454 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms